Код путника, бактеријска флора која се обично налази у интестиналном тракту може брзо да се промени, долази у контакт са "непознатим" клицама које покушавају да га колонизују. Први узрок путничког дијареје, у ствари, представљају патогени агенси као што су бактерије, вируси и паразити, способни да превазиђу баријере одбране и заразе наш организам. Међутим, други фактори могу повећати шансу за доживљавање путничке дијареје.
Дијареја путника се може појавити због промјене климе и температуре, стреса путовања и различите прехране. Обично је већа вероватноћа да ће овај поремећај нарасти у врућим влажним срединама, које карактеришу лоши санитарни услови. Током боравка у подручјима са највећим ризиком, морају се предузети одговарајуће мере предострожности у конзумирању воде, пића и намирница које могу бити контаминиране. Штавише, мухе могу да делују као пасивни вектори инфективних агенаса, узимајући их из једне хране у другу. Пажња и за купање, а не за воду из славине, чак ни за прање зуба. Чак и карактеристике путника су одлучујуће, као што су старост и претходна патолошка стања. Посебно, они који су имуносупримирани или на терапији лијековима који смањују киселост желуца (нпр. Ранитидин, омепразол, итд.) Су више изложени ризику од инфекције овог типа.
