Мелатонин није само комерцијално доступан у облику капсула или конфета. Такође су широко распрострањени сублингвални препарати мелатонина, али су такође развијени трансдермални фластери и орални спрејеви.
Неколико студија је показало да се 90% мелатонина у крви елиминише јетром у такозваном "првом пролазу"; због тога је полуживот веома кратак (30-60 минута).
Јасно је да модалитети примене утичу на биорасположивост мелатонина. На пример, израчунато је да се у просеку само 33% унесеног мелатонина апсорбује кроз гастроинтестинални тракт, при чему су интериндивидуалне варијације у распону од 10% до 56%.
У случају сублингвалне администрације, међутим, количина мелатонина која достиже циркулацију могла би бити 50% већа.