Од 2 до 21 дана након инфекције, први симптоми еболе су појава грознице, интензивна слабост, бол у зглобовима и мишићима, главобоља и ларингитис, затим повраћање, дијареја и бол у трбуху. Од петог до седмог дана може се развити карактеристичан осип, са тачкама и малим мехурићима.
Како болест напредује, може доћи до отказивања јетре или бубрега, проблема коагулације и крварења из гастроинтестиналних мукозних мембрана и гениталних органа. Пацијент обично има између 6 и 16 дана да се бори и победи вирус, иначе озбиљно крварење и кардиоваскуларни колапс могу довести до смрти. Смртност варира у зависности од врсте вируса еболе и пружене неге.
