Заштитна активност чилија и његова карактеристична активна супстанца - капсаицин - против гастритиса и пептичког улкуса доказана је у неколико студија, до те мере да се данас проучава повезаност капсаицина са аспирином и другим. НСАИДс да смањи штетне ефекте ових лекова на слузокожу желуца.
Нека истраживања сугеришу да капсаицин има и антимикробну активност против бактерије Хелицобацтер пилори, главног узрока пептичког улкуса и хроничног гастритиса код људи. Ова активност је такође демонстрирана на сојевима Хелицобацтер пилори резистентним на метронидазол и у складу је са резултатима неких епидемиолошких студија; статистика показује, у ствари, да је у одређеним популацијама у којима се широко распрострањена љута паприка појавност чира на желуцу нижа.
На основу концентрација тестираних у ин витро студијама, да би се постигао антибиотски ефекат против Хелицобацтер пилори, унос љуте паприке треба да буде конзистентан (од 3 до 9 сирових паприка дневно у зависности од садржаја капсаицина); међутим, треба навести да поред капсаицина, друге супстанце присутне у чили паприци (фитокомплекс) могу да имају синергистичку активност, смањујући минималну ефективну дозу. Штавише, синергија са урођеном одбраном желуца могла би додатно смањити дозу чилија довољна да елиминише Хелицобацтер пилори из желучане средине.
Недавни преглед односа између потрошње чилија и рака желуца (у вези са којим постоје сукобљене студије), препоручује умереност у уносу капсаицина, како би се у потпуности искористиле његове потенцијалне користи без ризика. Позив, међутим, важи нарочито за оне популације (као што је мексичка), гдје је уобичајена конзумација чили паприке и концентрација капсаицина у конзумираним сортама, очигледно виша од талијанских навика.
