Вирус Марбург је добио име по истоименом немачком граду, где се први пут појавио 1967. године, када је изазвао три истовремена избијања у Немачкој (градови Марбург и Франкфурт) иу бившој Југославији (Београд). У обе земље, вирус Марбурга вероватно је уведен увозом угандских зелених мајмуна ( Церцопитхецус аетхиопс, такође познат као сиво-зелени Церцопитецо).
Први случајеви су забележени међу особљем лабораторије у блиском контакту са овим приматима. Секундарни случајеви су укључивали медицинско особље у болницама изложеним зараженом биолошком материјалу.
Након тога, спорадичне епизоде или епидемије су забележене у Јужној Африци, Кенији, Демократској Републици Конго и Анголи, укупно око 600 случајева и 480 смртних случајева.
