Патогенеза истражује развој болести и ланац догађаја који су са њом повезани, који корак по корак одређују морфофункционалне промене ћелија и ткива које припадају погођеним органима. Ове промене могу бити узроковане хемијским, физичким или биолошким агенсима (вируси, бактерије итд.).
Док етиологија дефинише узроке, патогенеза проучава њене последице.
У читању медицинских текстова можемо их, дакле, сусрести у терминима као што су: микробиолошка патогенеза, упална патогенеза, вирусна патогенеза, малигна патогенеза (тенденција болести, углавном тумор, да се прогресивно погорша да постане потенцијално смртоносна). Многе болести препознају различите узрочне факторе (мултифакторијску етиологију), а још су бројније оне које карактеришу различити еволуцијски механизми (вишеструка патогенеза).
